От храма времен Алевиза Нового сохранился только подклет из белого камня. Остальная часть храма в конце XVII века подверглась перестройке. Новое храм имел одну главу, и в его выполнении прослеживался стиль барокко, который в то время только начинал проникать в архитектуру русской столицы. На высокий, увенчанный куполом четверик водружен восьмерик со световыми окнами. Глава храма выполнена в луковичном виде на нешироком барабане. Отделка четверика делает храм более изящным: верх его отделан арочными дугами карнизов, с двойным узорчатым пояском под ними. Окна в основном объеме и апсиды окружены резными наличниками. Выделяется пестрыми красками на белой стене перспективный портал, восстановленный в 70-х годах ХХ века.
В ходе реставрации храма в 90-х годах ХХ века внутри его были найдены древние фрески, своим стилем напоминающие роспись в соборе Василия Блаженного. Кроме этого, уцелели выполненные из мрамора иконостасы начала ХХ века.В XVIII веке к зданию церкви пристроили трапезную, а недалеко от основного строения, на Пятницкой улице, возвели трехъярусную колокольню. Трапезная привлекает внимание рядом красиво отделанных окон, которые разделяются пилястрами. Нижний ряд окон трапезной наполовину ушел в землю. Колокольня, сочетающая в себе элементы раннего классицизма и барокко, выделяется своими разнообразными ярусами. Нижний ярус колон – дорический, колонны среднего выполнены в ионическом ордере, а верхний ярус выделяется наиболее пышным, коринфским ордером. Фронтоны в двух нижних ярусах добавляют храму величия и торжественности.
Во времена СССР в здании церкви располагалось управление продтоварами райотдела Советского района. В 70-х годах началась реставрация храма. Позже в нем устроили выставку «Художественное стекло». И хотя ныне храм передан прихожанам, службы в нем проводятся нерегулярно, и доступ в храм не всегда открыт. Но даже внешнего вида этого прекрасного ансамбля в Черниговском переулке достаточно для привлечения внимания гостей столицы.
